Магомеду Магомедову предъявлены обвинения по ч. 2 ст. 205.1 УК РФ (содействие террористической деятельности с использованием служебного положения), ч. 2 ст. 105 УК РФ (убийство двух и более лиц общеопасным способом группой лиц), и ч. 4 ст. 160 УК РФ (присвоение или растрата в особо крупном размере).