Денис Попов назначен статс-секретарем - замминистра по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий.

С февраля 2018 года по сентябрь 2019 года он возглавлял прокуратуру Дагестана. После возглавил прокуратуру Москвы, где проработал до августа 2024 года.